Se supone que en la época romana Morales ya existía, ya que diversos restos así lo atestiguan.   
    Más adelante, fue Alfonso III el Magno ( 866-910 ) el que restauró y afianzó las fronteras del Duero,  ésta fue la línea entre cristianos y musulmanes en esta época repobladora  de la que data posiblemente el castillo o fortaleza que hubo en Morales.      
    En el año 1153 Morales quedó incluido dentro de la demarcación de la Tierra de Toro que hizo el nieto de AlfonsoVI,  Alfonso VII, Emperador de España,  quien concedió a Toro estas tierras.   
    Fernando III el Santo ( 1217-1252 ) sacó a Morales del Alfoz de Toro para donarla en 1222 a su  esposa,  hija del duque de Suabia,  Emperador  de Alemania.  Para al poco  tiempo pasar a  la Orden Teutónica.     
    Pedro I el Cruel sucedió en el trono a su padre Alfonso XI,  y su reinado    ( 1350-1369 ) es bien conocido; durante su reinado es cuando  mayor número  de veces aparece citado  Morales en los escritos de la época.    
    Durante el reinado de Felipe II  la Corona necesitó mucho dinero, Morales fue vendido en Señorío a Rodrigo de Ulloa, Señor de la Mota, esto sucedió en el año 1573.   
    En 1812 desaparece el Señorío de la Mota sobre Morales.    
    Durante el primer  cuarto de siglo,  reinando  Alfonso XIII,  Dictadura de Primo de Rivera  y República, el pueblo no cambia apenas nada.Durante la dictadura del General Franco, el pueblo fue asimilando todas las innovaciones que configuran la vida económica y agrícola del pueblo.    
    En los años de  la postguerra civil hubo  un acontecimiento muy  importante para  la vida del pueblo:  el fenómeno emigratorio.  En 1944 Morales tenía  unos 2.500 habitantes. Apartir de éste año el pueblo comenzó a perder habitantes, bajando del año 1959 al 60 de 2.043 a 1.886; en la actualidad hay 1.300, cifra que parece ya mantenerse.

      Iglesia de San Salvador                               Casa del Concejo en 1589